Sejarah Kelurahan Pakunden di Kota Kediri erat kaitannya dengan sejarah umum wilayah Kota Kediri dan memiliki nuansa lokal yang kuat, terutama terkait budaya dan tradisi, seperti peringatan hari jadi dusunnya (misalnya Dusun Bence) yang menunjukkan upaya melestarikan sejarah lokal, meskipun detail pendirian kelurahan spesifiknya belum tersaji lengkap, namun terintegrasi dalam sistem administrasi Kota Kediri yang berdiri resmi tahun 1950. Terdiri dari 42 RT dan 7 RW Kelurahan Pakunden terbagi menjadi 2 Wilayah, Lingkungan Pakunden dan Lingkungan Bence.